常見腦神經疾病基因測試
關於腦神經疾病比較常用嘅基因測試:
Single Gene Testing, e.g. SCN1A, PCDH19 (醫生根據臨床觀察十分肯定腦癇是因某個特定基因變異而起, 繼而安排做特定嘅單個基因測試, 所以呢啲測試有陰性結果並不代表病人完全沒有基因問題)
Chromosomal Microarray (CMA, 喺染色體層面搵基因問題, 層次較高, 即較微細嘅基因變異或缼損未必能搵到, 喺一有明顯病徵嘅發展遲緩/自閉頻譜個案, 會建議做呢種測試)
Gene panel (根據數據庫內常見引致腦神經疾病嘅基因去喺患者樣本內配對。市面上有好多唔同類型嘅panel, 例如腦癇、腦神經肌肉病、腦神經代謝病或腦萎縮等都有獨立嘅panel, 每個panel會睇嘅基因數目由幾條到百幾條不等。可根據病情同醫生討論要做邊款)
Whole Exome Sequencing (WES) 將DNA排序拉開, 搵出編程部份 (exon) 嘅問題
Whole Genome Sequencing 因WES仍然搵唔到問題, 再去搵非編程部份(如intron, codon)嘅問題....
Epigenetics 即基因因環境因素而改變表達,但有啲不著邊際,所以我唔多講
Single Gene Testing, e.g. SCN1A, PCDH19 (醫生根據臨床觀察十分肯定腦癇是因某個特定基因變異而起, 繼而安排做特定嘅單個基因測試, 所以呢啲測試有陰性結果並不代表病人完全沒有基因問題)
Chromosomal Microarray (CMA, 喺染色體層面搵基因問題, 層次較高, 即較微細嘅基因變異或缼損未必能搵到, 喺一有明顯病徵嘅發展遲緩/自閉頻譜個案, 會建議做呢種測試)
Gene panel (根據數據庫內常見引致腦神經疾病嘅基因去喺患者樣本內配對。市面上有好多唔同類型嘅panel, 例如腦癇、腦神經肌肉病、腦神經代謝病或腦萎縮等都有獨立嘅panel, 每個panel會睇嘅基因數目由幾條到百幾條不等。可根據病情同醫生討論要做邊款)
Whole Exome Sequencing (WES) 將DNA排序拉開, 搵出編程部份 (exon) 嘅問題
Whole Genome Sequencing 因WES仍然搵唔到問題, 再去搵非編程部份(如intron, codon)嘅問題....
Epigenetics 即基因因環境因素而改變表達,但有啲不著邊際,所以我唔多講
以仔細程度去排序
Single gene < CMA ~ Gene Panel < WES < WGS
如果單一基因測試已係陽性,咁唔使再做其他;再推到gene panel或染色體,gene panel的話, 醫生有線索的話就可一次睇一堆可能性,唔使孤注一擲;染色體的話,有啲嚴重嘅基因缺損就咁望染色體已見到,如未有先例,gene panel亦冇結論,家人好想搵到係邊一條(或幾條)基因出問題,可再推向WES,當然亦可喺呢度停步;WES有幾大機會搵到病因亦睇係咩病,如腦癇,WES大概有三成機會搵到,某啲心臟病大概有五成機會;WES仲係冇答案,下一步就係WGS
Single gene < CMA ~ Gene Panel < WES < WGS
如果單一基因測試已係陽性,咁唔使再做其他;再推到gene panel或染色體,gene panel的話, 醫生有線索的話就可一次睇一堆可能性,唔使孤注一擲;染色體的話,有啲嚴重嘅基因缺損就咁望染色體已見到,如未有先例,gene panel亦冇結論,家人好想搵到係邊一條(或幾條)基因出問題,可再推向WES,當然亦可喺呢度停步;WES有幾大機會搵到病因亦睇係咩病,如腦癇,WES大概有三成機會搵到,某啲心臟病大概有五成機會;WES仲係冇答案,下一步就係WGS
值得一提嘅係基因測試同研究係動態嘅, 即每次有人搵到基因問題就會入庫,同大原則主要係配對, 即之前喺某啲病人身上搵到某啲基因而又有某啲問題,所以如搵到一個基因問題呢, 醫生就會總結小朋友將來可能會有咩身體或發展上嘅問題,但因呢啲科技既新且貴,有時數據庫入面資料有限,一兩個案例有嘅健康問題,有時並唔代表所有有相同基因問題嘅病人都會有一樣嘅健康問題。同埋今日搵唔到答案,可能幾年後會有,尤其係WGS,科技同人才兩方面都係發展中,雖然有實驗室可排序同輸出原始數據,但醫生都未必識解讀,要搵專才去睇,要時間亦要金錢。真係有心做WGS,好需要同學界溝通,畀誘因佢哋為病人爭取資助同人力資源。雖然話WES/WGS已大致市場化,但都未去到話有份簡單易明報告可畀家人自己睇咁普及。WES啲報告靠Google勉強都可睇得明,WGS應該會難啲...
至於點解要搵邊條基因:
1)有啲病係已發現咗好耐,已有前人行過條路,知道邊啲藥或治療好,邊啲會越用越差,可能點都根治唔到,但叫行少啲冤枉路,冇「救返」、「醫好」個小朋友起碼都唔好踩地雷
2)加入相關病人家庭互助群組,可資源共享,或可得到臨床試驗資訊,搵到有效嘅治療對策。亦可同同路人分享日常護理心得同互相支持
1)有啲病係已發現咗好耐,已有前人行過條路,知道邊啲藥或治療好,邊啲會越用越差,可能點都根治唔到,但叫行少啲冤枉路,冇「救返」、「醫好」個小朋友起碼都唔好踩地雷
2)加入相關病人家庭互助群組,可資源共享,或可得到臨床試驗資訊,搵到有效嘅治療對策。亦可同同路人分享日常護理心得同互相支持
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